(一)办公室。组织协调机关日常工作;负责文电、会务、机要、保密、档案、督查、环保信息、政务公开等工作;组织起草重要综合性材料;负责重要批示件督办工作;负责建立健全机关各项规章制度;负责年度工作目标责任制的实施和考评;负责机关行政后勤、财务、卫生管理和安全保卫工作;负责管理市级环保专项资金;负责提出环境保护政府财政性资金安排初步意见;负责机关政府采购以及招投标相关事宜和国有资产监督管理;负责机关和直属单位机构编制、人事管理工作;负责党风廉政建设和行风建设工作;负责创建文明单位工作;负责市人大代表建议、市政协委员提案办理的组织协调;指导环保系统人才队伍建设;负责离退休干部服务管理工作。

(二)法规宣教科(挂督察整改办牌子)。贯彻实施国家和省、市环境保护方针、政策、法律、法规和规章;组织指导环境保护宣传教育工作;参与环境保护有关规范性文件的起草工作;承担有关规范性文件的合法性审核;负责环境保护政策调研和制度体系建设;承担环境行政处罚、复议案件等相关的法制审核工作;组织应对行政诉讼案件;推进环境保护依法行政工作;负责环境保护行政执法监督;参与处理环境违法案(事)件;提供环境保护法律咨询;负责企业环保信用评价;组织实施环保督察整改工作。

(三)生态科。组织、协调全市生态文明示范创建工作;组织编制生态保护规划;组织实施生态环境质量状况报告;监督对生态环境有影响的自然环境开发利用活动、重要生态环境建设和生态恢复工作;监督指导农业面源污染治理工作;指导、协调农村环境保护工作;协调各种类型的自然保护小区、风景名胜区、森林公园的环境保护工作;协调生物多样性保护、野生动植物保护、湿地环境保护工作;开展各类生态创建工作;承担市美丽兰溪建设领导小组办公室日常工作。

(四)行政审批科(挂辐射环境管理科牌子)。负责上级环保部门审批的建设项目环境影响评价文件审核;负责本级建设项目环境影响报告书(报告表、登记表)审批;负责建设项目竣工环境保护验收“三同时”;负责污染防治设施拆除或闲置审批;负责排放转炉气、电石气、电炉法黄磷尾气、有机烃类尾气审批;负责有害废物经营许可证、医疗废物集中处置单位的危险废物经营许可证核发;承担辐射环境、放射性废物管理工作;负责排污许可证的核发工作。

(五)环境管理科。组织开展流域性和行业性污染防治工作;组织开展环保规划编制、水功能区、水环境功能区划编制,制定和实施水污染防治计划,监督防止地下水污染;负责全市大气、噪声、光、化石能源等污染防治的监督管理;监督城市大气环境质量限期达标和改善情况。组织实施重污染天气应对政策措施;组织协调大气面源污染防治工作;组织实施声环境功能区和合格饮用水源保护区的管理工作;负责排污口设置管理及流域水环境保护;参与管理省级环保专项资金;负责安全生产工作;负责对从事放射性同位素与射线装置生产、使用、销售单位放射性安全的监督管理工作;配合有关部门实施清洁生产、绿色企业创建工作;组织实施污染减排综合工作;组织开展排污权有偿使用和交易试点工作;组织实施污染物总量控制;完成市局交办的其他任务。